2010年2月22日月曜日

CyteScape

ネットワークを描画したいので,CyteScapeを使ってみる.

まず,ネットワークデータを作成.

6 3
6 4
8 2
6 2
4 2
9 8

みたいなデータ.これが,リンク構造を決定している.
6と3にリンクを張る,みたいな感じ.
network.netみたいな名前を付ける.

File=>Import=>Network from Tableを選択.

こんなのが出てくるので,「network.net」を開く.
で,Source InteractionにColumn1を,Target InteractionにColumn2を選択.
Interaction Typeは放っておこう.
で,Importをポチっとね.
これで取りあえず完成.
Layout=>CystoScape Layout=>Force Directed=>No Weight
で見やすい形になる,と.

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